連在海底都慘遭恐佈的邪惡火車入侵，夢奇地真的沒有救了嗎？木匠最後要愛麗絲去找毛毛蟲王，在過場讀取時，愛麗絲有一段評語：「毛毛蟲王有著睿智的想法，我最好尋求他的建議。」
回到現實世界，愛麗絲與Nanny Nan Sharpe離開了被Jack Splatter縱火的「受傷美人魚」（Mangled Mermaid），顯然愛麗絲被Jack揍昏之後被Nanny給救了出來。
Alice（以下簡稱A）：「喔…什麼？我嘴裡的血嚐起來像膽汁的味道！那畜生打我哪裡啊？Nanny？」
Nanny Nan Sharpe（以下簡稱N）：「可憐的傻瓜昏過去就算了，沒死就不錯了！」
A：「他到底想要什麼？」
N：「他們都想要一樣的東西，他沒拿到手的錢…妳的思考範圍怎麼變得亂七八糟？妳可能會被殺掉的！」
A：「Nanny，我的記憶變得零零碎碎的，我甚至還有些很恐佈的影像在我腦海裡，我想要知道這到底是怎麼一回事！」
N：「關於那場大火啊…我只能一再告訴妳，妳要想往後的日子怎麼過啊，愛麗絲，當然我也是。
進入動畫。
N：「至少她不像在精神病院裡吐些廢話出來了。講著『我的過去要消逝了！我殺了他們，我應該要救她們的！讓我死了吧！』她就像在殘殺現場一樣，Radcliffe想熟悉的面孔可能會讓她記住，過了一年，他就失去對愛麗絲得到的遺產失去興趣，貪婪的王八蛋。不過繼續的，總是問她些奇怪的問題，我會說這讓她變得精神錯亂的主因。但是說真的這不會是這一生中最好的辦法啊！當她沒有在昏睡的時候，她目瞪口呆，而眼睛就像風火輪；又流著口水，偶爾驚聲尖叫，但從沒說出些正常的話。就像個小屁孩一樣，她封住了她的秘密。」
愛麗絲與Nanny乘著馬車來到了很有東方風格的地方，在路邊有些失神的小朋友以及心懷不軌的大人…
N：「騙子跟幸運兒（反諷那些小朋友）！就跟蟑螂一樣常見。那些可憐的小孩童要變成怪叔叔的食物了。就像清白的螞蟻們被黃蜂吃下肚，或像被蜘蛛捕食的傢伙。」
A：「妳曾經參觀過我在Rutledge（精神病院）的房間，妳有沒有…」
N：「妳記得？Rutledge讓我花了不少錢啊…一個女人有時候會獨自做些她沒辦法說明白的事…就如你所知。」
A：「Witless護士說妳在手頭很緊的時候墮落了…」
N：「我不像她喝醉了。我從沒傷害過任何人！色誘別人也不是多糟的人生…」
A：「除了拉皮條之外。她也說妳也許拿了我的兔子。拜託，Nanny，可以透露一下…」
N：「…那場該死的火災？這不會有幫助的。聽好，愛麗絲，我沒辦法給妳我所沒有的東西，Radcliffe寫了篇審訊的報告。我得把妳帶給他，另外，他拿了妳那該死的兔子，妳要記得這件事。」
A：「好吧，但是Radcliffe先生就沒用了。」
N：「我會不知道嗎？」
雖然這麼說，愛麗絲還是起身前往Radcliffe的住宅兼律師事務所，想找回她的兔子布偶。來到大門，愛麗絲鼓起勇氣敲了幾下大門…
Radcliffe（以下簡稱R）：「你好，請問是哪位？」
A：「愛麗絲‧琳朵，Radcliffe先生。」
R：「啊，妳回來啦。我想妳最好趕快上來，注意門閂啊。」
進入Radcliffe的住宅我們發現非常異國的情調，一進門就可以看到中國風的陶瓷花瓶，不過這種大小應該是放地上吧…再往裡面走也可以發現許多山水墨畫，以及充滿中國風味的木製屏風和各式擺設。走上二樓的階梯上還可以看到日本武士刀的收藏，上樓後左轉的右邊房間可以看到Radcliffe坐在裡面，愛麗絲的兔子布偶竟然就放在桌上！走進房間後會觸發劇情。
A：「你拿了我的兔子！」
R：「妳忘記了妳應有的禮貌。還有什麼我覺得驚奇的？親愛的，妳把你的兔子留在Rutledge精神病院裡啊！我們已經討論過這事了。」
進入動畫。
R：「跟以往一樣，憤怒還有胡來的指控又從她的意見中洩漏出來了。我『偷』了她的兔子，這真是荒謬的說法。她在這裡又要開始講那場祝融之災了。這裡所有的瘋小孩都想討論那場火災啊！根據我的調查，她的家人是死於『意外』，但是她又不接受；繼續她的『屠殺回憶』還有她『我需要知道真相』的那些大吼大叫。目前已經被斷言的事實：這場火災起因於在書房的小貓撞倒了油燈。大火困住了她在樓上的雙親和姐姐。姐姐Lizzie連她房門也不開鎖，就這樣子死在自己的床上。那隻有罪的貓讓她崩潰，她堅持：『這沒道理！這不可能！』等等等，我同意！從一開始，我就認為愛麗絲是縱火犯的後補人選。這女孩注視著火焰。我一時察覺到她也許在這場悲劇中，扮演著更重要的原因。她還受苦於某種精神疾病吧。」
不知怎麼地，愛麗絲似乎很痛苦的摸著左額頭才回神…
A：「我有沒有把他的頭扭下來？我…我想…有什麼東西在我左腦快要爆炸了！」
四處一望結果發現超乎想像的Radcliffe書房，這到底怎麼回事？
A：「祈求有更好的幻覺會不會是瘋了？也許我注定要在這兒斷氣吧。」
接下來可以操縱愛麗絲自由行動，調查書桌時會顯示說：「所有可以搬動的東西都已經搬走了，只剩下灰塵、汙濁還有菸草的味道。沒有驗屍官的報告或是我的兔子，該死。」走出房間會發現房子破爛得非常誇張，這顯然不是荒廢個一兩天而已，往後門走去，會發現戶外竟然在飄著雪？！戶外還有個Mock Turtle的小雕像，這裡不是現實世界嗎？顯然不是，這裡顯然是現實世界與夢奇地的邊界了。往下走可以看到夢奇地的混沌場景…那輛巨大的邪惡列車繼續為了摧毀夢奇地而奔馳…
A：「這血腥的毀滅！他汙染了所有的夢奇地！」
Blasted Cat（笑面貓，以下簡稱B）：「想在風中殘燭的世界找個避難所嗎？也許可以在地獄裡『找到』吧。」
A：「你不是個那麼厲害的騙子而我也沒這麼笨。就算悲劇還少了這麼一塊拼圖才能被接受啊。」
B：「這個無法煞車的災難就是妳搞的，而且這只會越來越糟。妳的火車會繼續牠的地獄行程。趕快動起來！時間是不等人的，改變已經開始了…」
A：「火車完美地做出讓我恐懼的事了，笨貓。你應該找其他工作了。還有一絲希望嗎？」
B：「比一絲更少啊…而且如果恐懼癱瘓了妳，那我們就全盤皆輸了。」
結果這裡是愛麗絲回到夢奇地的「淚之谷」（Vale of Tears），只是現在已經徹底毀滅變成了「毀滅之谷」（Vale of Doom）了。玩家要穿梭在許多深不見底的浮游平台間移動。當然別忘了找出記憶的碎片還有瓶中信以及豬鼻子，當然「齒舌螺房間」（Radula Room）也別忘了喔！過沒多久，就可以拿到遊戲中最後一個武器道具：「茶壺加農砲」（Teapot Cannon），之後就要正面對戰「Colossal Ruin」。對付「Colossal Ruin」的戰法就是不斷地移動來保持距離，並且趁牠身體上的臉露出來的時候使用「茶壺加農砲」伺候，當身上的臉都打光了，牠會進入火車模式往愛麗絲衝過來，別忘了運用「兔子定時炸彈」當誘餌，或著是直接往牠頭上的臉用「茶壺加農砲」打下去，這時牠會停止動作，換上「Vorpal Blade」用力砍下去，改滿的「Vorpal Blade」不管在攻擊速度或是反應都是最推薦的。但是要小心，在牠攻擊移動時盡量不要靠近到牠身邊，不然會被牠吞進去造成大量失血。
在行進的路上到處都是夢奇地的各式殘骸，這到底為什麼會變成這樣呢…最後來到了一處僅存的綠地，這看似空無一物的地方，愛麗絲走進水池中間，發現石頭上有個小小的五重塔…
謎之音：「妳在成長過程中好像對於吸煙的特技很熟悉喔？」
A：「大人欺負小孩子都用格言，而且通常嘴裡都會叼著他們的煙斗呢。」
謎之音：「我不會問妳要不要吸一口，就讓煙罩住妳吧！」
其實這段對話滿精彩的，因為愛麗絲剛剛在操作機關時都會吐出一口水煙，謎之音因為體型太小，所以反諷愛麗絲的「巨人體型」，而愛麗絲也舉了會欺負小孩子的大人形象很多都是叼著煙斗講著大話，謎之音就順勢讓縮小煙霧圍繞愛麗絲反將一軍，究竟謎之音是不是愛麗絲要找的「毛毛蟲王」呢？
縮小之後愛麗絲來到了「神秘之東」（Mysterious East）。這裡充滿東方風格的青瓷、玉器還有書法文字等等，看來這個小小世界還未被邪惡的列車破壞污染，不過好像有點怪怪的…所以玩家操縱愛麗絲慢慢地往塔頂前進。結果在路上發現被屠殺的螞蟻村，接著馬上會遇到手持日本刀的「Samurai Wasp」，基本上只要用「Vorpal Blade」衝過去在牠沒有持刀防禦時近戰猛砍即可，或著用「Hobby Horse」破防就可以輕鬆克敵了，當然也可以用「茶壺加農砲」轟炸或「兔子定時炸彈」來引誘再攻擊。
來到另一個村子的入口笑面貓說了句與一代息息關聯的話：「『她拯救一個靈魂就代表就了全世界呀！』記得嗎？」進入村子後擊敗幾隻「Samurai Wasp」便會遭遇「Daimyo Wasp」，基本上對付牠的戰法與「Samurai Wasp」相同，只是要小心牠的衝擊波及震地攻擊即可，最快的方式就是用「茶壺加農砲」轟牠一發讓其陷入暈眩狀態，然後就可以近戰砍爽爽了。接著進入類似避難所的廟宇。
「她是被選上的人嗎？」
「我們的救世主？」
「我們的恩人哪！」
在廟宇裡面也有一些機關可以操作來取得記憶的碎片。來到對岸，必須接受一個小小的測驗，就跟第二章一樣的蒐集並完成拼圖，才能通過這個大門。
拼圖全貌。
螞蟻長老：「妳那成功的戰鬥和解謎讓人聯想到妳有辦法面對任何挑戰。精神上的力量會證明妳的價值…或是宣佈妳就到此為止！」有了第二章的經驗想必玩家們應該都可以輕鬆的解決這個小小的考驗，在解決之後…
螞蟻長老：「妳可以拯救我們！我來開路吧！」
然後長老開門之後愛麗絲就可以繼續往前走…然後再一次遇到長老。（其實長老才是最神的…）
螞蟻長老：「邪惡的黃蜂們圍攻我們，而且控制了山峰的東邊與西邊，妳得打敗牠們才能到達毛毛蟲王的修行處哪。」
A：「我猜我得爬上山頂才行，畢竟山頂不會跑到我面前。」
螞蟻長老：「我們信任毛毛蟲王，在困境中會展現得不可思議與神妙奇蹟，總有一天我們得來體現這點。純潔的心靈是必備的。為了抵達他神聖的住所，妳得通過兇猛的『大名主』（Daimyo），『大名主』阻礙了我們進入毛毛蟲王神力的庇護。我會打開神聖洞穴的入口，你的旅途就從這開始…」
愛麗絲往下走就可以滑到一個封閉的房間裡，這裡面有一張極似中國山水畫的掛畫，玩家只要靠近按X即可進入畫中的世界，裡面除了沒辦法攻擊之外，移動和跳躍的方式皆和平時一樣，不過也可以趁機收集牙齒和畫中世界的水蜜桃，只要在所有的畫中世界收集完水蜜桃也有成就可以解喔！所以記得到處看看，如果真的漏掉了也可以用選擇章節的方式回來收集。
走出畫中世界就可以打開通往外界的大門，這時笑面貓又出來說了：「只有笨蛋才會相信，受苦是活出自己的報應。」這句話真的相當有意思。另外這邊是關卡中相當有趣的地方，充滿中文的畫軸不斷的往後捲動，然後有「火」字的地方會讓愛麗絲受到灼傷，還有「Samurai Wasp Archer」這種飛行系敵人，請務必小心。
然後順著關卡設計的路線走，有了前兩章的歷練，應該不會有什麼問題，別忘了有些機關要運用「兔子定時炸彈」來延長通關時間喔！另外遇到本章節特有的敵人「Samurai Ink Wasp」，這種飛行類敵人的解決方式與第一章的「Bolterfly」相同，先解決上面刻有「蝗」字的小石碑，牠們就不會一直再生了，要是被抓住也是用「縮小」或「蝴蝶順移」就可以掙脫了。接著來到了燃燒中的記憶閘門…
火源到底是不是從書房的壁爐開始的呢？現在還不能確定，但是最重要的一點是…
A：「Dynah（愛麗絲家的貓）救了我！我得救是因為…牠教我怎麼逃出去！我沒有把油燈留在書房而且Dynah也沒有把油燈打翻哪！當我上床睡覺時油燈跟Dynah都在樓上，Dynah在火災開始的時候是跟我在一起的！」
什麼？！由此可見愛麗絲以及Dynah的清白，這麼說來兇手另有他人了…事情的發展真是讓人不寒而慄啊…
跟各位玩家朋友說聲抱歉，由於種種原因導致本系列劇情攻略進度嚴重落後，目前繼續趕工接下來的章節讓玩家朋友盡快輕鬆了解劇情內容，還請各位見諒。
